11时，68师师长王绍辉同副参谋长一行5人携带，西屿岛和白沙岛及各周边岛屿的防御图，及连级以上的军官花名册，乘一艘巡逻艇来到了澎湖本岛，我澎湖前线指挥部。
海军陆战一师政委接待了王绍辉一行。
双方相会，在马公市的会议室内，气氛十分友好。确定了国民党68师起义的行动步骤：一，对68师内反对起义者要坚决予以镇压。二，通电表态脱离蒋介石反动集团，站在人民一边，坚决拥护中央人民政斧。三，68师在我军接防后，撤到澎湖本岛接受整编。四，68师从现在起遵守解放军三大纪律，八项注意。
为了震慑国民党顽固派，给王绍辉撑腰，两艘火力支援舰开进了澎湖湾水域。
9月4曰凌晨3点，28军全军和炮兵7师一部，乘坐返回的20艘登陆舰，分别登上了澎湖本岛和白沙岛，西屿岛及各周边岛屿，全面接管国民党68师的防御阵地。此时澎湖列岛我军已达60000多人。
国民党68师与我军接收部队友好的交割了防区阵地，营房和各种装备物资后。逐次分批的撤到澎湖本岛。对一些老弱病残和不适应留在解放军的人员予以转业处理。家在大陆的愿意回老家的送回老家。不愿回老家的送到琉球生产建设兵团。剩下7000余人被改编为中国人民解放军澎湖警备一师，68师师长王绍辉被任命为澎湖警备一师师长兼解放军澎湖前线指挥部副参谋长。
澎湖列岛失陷使台湾上下陷入了一片恐慌之中。
9月4曰蒋介石一反常态，身着五星级上将戎装来到了总统府，召集国防部紧急会议。在总统府的会议室内，国防部长俞大维，陆军总司令孙立人，参谋总长兼空军司令周至柔，海军总司令桂永清，空军副总司令王叔铭，联勤总司令黄镇球，国防部长政治部主任蒋经国早已等候在这里。看蒋介石走了进来，大家一纷纷站起来向蒋介石敬礼，问好。蒋介石双手轻轻的向下压了压手，示意大家坐下。
俞大维看人都到齐了宣布开会，他首先介绍了澎湖失守经过，向与会的国民党军界高官们。说明了当前台湾所面临的形势。最后他说：“就如何防止共军登陆台湾，请诸位发表高见。”
海军总司令桂永清抢行发言：“现在共军飞机十分猖獗，而且，炸弹的威力巨大，尤其是那种钢珠弹。只要是一两枚就可以把一艘驱逐舰甲板上的人大部分杀死杀伤，为了防止共军对台湾的进攻必须首先遏制***]的空军。没有制空权，我们海军的舰艇只是***]空军的靶子，有多少也不够他们炸的。另外为了防止共军登陆，应在海面和海滩大密度，多层次的布雷。”
联勤总司令黄镇球插话说：“几百公里的海岸线，你让我上哪整那么多的水雷，地雷呀？”
国防部长俞大维说：“水雷不够可以保重点吗。在重点地区，重点海域布雷。”
“话是那么说，可是哪儿是重点地区，重点海域？”参谋总长兼空军司令周至柔说：“这次共军登陆澎湖就大大的出乎我们的