魏胜田和林斯特以及陈敬云都表示赞同了，下面的一众人自然表示同意
紧接着，就是讨论军政府的构架组织问题，其实这些问题之前同盟会和陈敬云之前就已经有过商讨，但是那时候同盟会的主要精力都放在如何起义上，陈敬云的注意力也都在争夺军权上，对这里政府构架就没有过多深入的讨论。不过这类事情有湖北那边的军政府样板当参照，也不用费太多精力，很快一个大体的军政府构架就拿了出来。
全称为福建军政府，之所以称福建不称福州，自然是为了大义名分，如果只是叫福州军政府的话，从名义上就只是一个城市的军政府，对整个福建无统属名义，这点是陈敬云决不能接受的，郑祖荫和魏胜田等人也觉得福建光复大业还等着他们继续进行，自然也不愿意把脚步局限在福州一城。
福建军政府下属的各部中，原本郑祖荫等人是想要照搬湖北那边的，但是陈敬云说福建有福建自己的局限性，不能一一照搬，同盟会诸人一想也是，当即就是在湖北军政府的基础上另行设置。
即设：军务部、民政部、财政部、外交部、司法部、工商部、教育部、交通部、监察部共九部，其中各部职能从名字也能看出来。九大部确定下来后，魏胜田道：“军政府构架已定，下面我推举陈敬云为福建军政府都督，掌管一切军政事务”
一听到这话，下面众人立即就是慎重了起来刚才讨论政府构架的时候，他们并不在意什么，他们在意的是什么人能当什么职位，比如这个都督之位。
要当这个都督之位，可不是说随便推举一个阿猫阿狗就可以的，至少在场众人中符合资格的没有几个。郑祖荫在福建同盟会内部的威望是足够了，但是对于新军以及福建省内民众而言是不可能的，民众尚且不说，陈敬云手下的军队也不说，恐怕就连林文英等同盟会掌控下的新军也不会承认的。魏胜田是外来户，来福建不过半个月，连人都不认识几个，如果他不是顶着孙中文的名头来，估计都没人搭理他。剩下的林文英和萧奇斌对于新军而言，威望都嫌不足，更不用说其他人了。
这年头，威望这东西说有也可，说无也可最明显的例子就是，袁方对李继民和林文英的劝降嗤之于鼻，但是收到了孙道仁的信并见到陈敬云后，立马就投诚了。换句话说，如果让林文英和萧奇斌当都督，别说劝降秦玉年等其他新军了，估计城内的新军立马就得乱了。
其实，他们还有一个很好的选择，那就是许崇智。但许崇智远在邵武府，那里也有好几个营的新军需要劝降以及强有力的高级将领来掌管，短时间内是不可能回到福州来，更何况，就算他能回来也得好几天之后了，几天时间过去了黄瓜菜都凉了，更别说都督之位了。
众人想来想去，都是把目光投向了陈敬云
现在的陈敬云可以说是最好的选择，首先，他是同盟会成员，尽管他才加入同盟会没几天但那也是货真价实的同盟会成员，第二，他有足够的军事威望，现在已经是福建国民军总司令的他号令城内所有新军，日后