自十一号孙文颁发临时约法引起舆论纷纷之际，三月十号袁世凯在北京正式就任大总统后，同日袁世凯任命唐绍仪为国务院总理，十五号，命令各省督抚一律改成都督，山东的张广建根据袁世凯改称山东都督，但是手下的前朝文官武官照旧供职，无一改变。而福建的陈敬云本来就是都督这个名头，也就不用改了。
四月一号，原本还撑着辞职不解职的孙文在中外压力下终于宣布正式解职，次日南京参议院通过决议，临时政府搬迁到北京，参议院也随同一起搬迁到北京。自此，南北的定都之争以孙文彻底失败的结局尘埃落定。
虽然南京临时政府要搬迁到北京，但是南京附近的数十万民军可不能一起北上，于此同时南方的革命党人对袁世凯还是有所防备的，所以建议把南京临时政府变为留守政府，对于这些表面功夫袁世凯也不好做的太绝，加上南京周围的数十万民军的确是个麻烦事，所以干脆就认命黄兴为南京留守，任旧统辖南方军队。当时革命党人正在支持黄兴和段祺瑞争夺陆军总长一职，可是袁世凯对军权根本不会放手，无奈之下黄兴也只好答应出任南京留守。
南京留守虽然给南方革命党保留了一丝希望，但是他面对的麻烦却是更大，因为有了这个南京留守那些民军就还得找黄兴要军饷，南京的财政之困难已经不用再多言，开始的时候不对还能吃米饭，然后就是稀饭，过几天连稀饭都没得吃了。黄兴天天给袁世凯发电报要军饷，可袁世凯又不是傻子，要是能拿出钱来替敌人养军才是怪事了，所以直接命令财政部的熊希龄，一个铜子都不能给
北边不给钱，没办法只能自筹，可是现在南京连临时政府都搬走了，没有名头借也借不到，更没有各省给他们送军饷去，可以说是没有任何收入来源。
部队没吃的，远离南京的一些部队还好，利用各种办法还能在地方上筹款筹粮，但是驻守南京的部队就没那么好运气了，这些好几个月没发军饷，几天没饭吃的军队终于是开始大规模的哗变。
兵变之规模比起北京的那场兵变有过之而无不及，驻扎南京的第七师赣军一部首先开始哗变，乱兵们在南京太平桥，白门桥一带大肆抢劫，烧杀劫掠，抢劫钱粮还不算还杀害商家，强奸良家妇女，总之这年头乱兵能干的事他们都给干了，然后紧接着又有数股民军开始哗变，此时，远在上海筹款的黄兴得到消息后立即命令驻守南京的各部镇压哗变，随后，驻宁各军开始镇压叛乱，而且是拿出了真正内战的劲头，用着极度残酷的手段在南京城内杀了个昏天暗地，混战中无数商家民众被抢劫杀害，一日间，南京成人间地狱。
等到黄兴回到南京后，看着面目全非的南京说不出话来，走过街头甚至感到了民众对他投来的憎恨眼神，耳朵里似乎听见有人在骂他祸国殃民。他怎么也不相信，这些号称是革命军队的民军竟然能够做出这样的事情来，甚至有那么一瞬间他都怀疑，他一直以来所做的一切是否还有意义革命到底是对的还是错的
再联想到前些时候几乎全国人都抛弃了