正式番号一样的，都是中央陆军第某某师，中央陆军第某某混成旅。不过正式番号如此，但是人们说的时候还是沿用北洋军，南边的称之为南方军。
陈敬云的嫡系部队国民军番号只是变动了几个字而已同样的桂军和滇军变动的也不大，给予桂军的番号是中央陆军第五军，陆荣廷自然是军长，原桂军的六个师虽然是仿效的北洋编制，但是不管人数还是火力都是严重不足的，一个师的人数不过七八千人。如此情况下，就给了第五军三个师的番号，分别是第十二师、第十三师、第十四师。至于陆荣廷自己怎么分配这三个师的番号那是他自己的事情。
陆荣廷也干脆，当即就是把三个人数和装备较好的三个师改编为中央陆军师，然后剩下三个师被抽调了部队人员和装备后缩编为三个混成旅，并向陈敬云要了三个混成旅的编制，陈敬云也不阻拦，直接批准了陆荣廷的的要求给了第六、第七、第八混成旅的编制。使得第五军拥有了三个师，三个混成旅的部队，总兵力高达四万余人。
滇军的改变也很简单，陈敬云给了唐继尧两个军，六个师的番号。滇军的编制比桂军要标准的多，之前滇军是分成了两种编制，一种是仿效北洋以及前清新军的四团满编制，除了炮团和骑兵团不能满编外，四个步兵团还是能够满编的，另外还大量建立了两团制的混成旅。严格上来说滇军的编制和北洋军是极为相似的，而这样改编起来就方便多了。
唐继尧把驻扎在四川的两个师以及三个混成旅合编为第六军，还把其中两个混成旅合编为一个师，给第六军筹足了三个整编师另外加一个混成旅。番号分别为第十五师、第十六师、第十七师、第九混成旅，总兵力达四万余人。军长为韩建泽
留在云贵两省内的其他滇军被整编为第七军，其中有三个师和四个混成旅。三个师直接改编为中央陆军师，剩下的四个混成旅也不动，直接换上了中央陆军混成旅的名号，番号分别为中央陆军第十八师、第十九师、第二十师、第十混成旅、第十一混成旅、第十二混成旅、第十三混成旅。使得第七军拥有三个师、四个混成旅，总兵力近六万余。军长由唐继尧亲自担任。
滇军和桂军的整编计划里，主要内容就是换了个部队番号，其他的部队编制，指挥权，乃是人事都不会变动，任旧保持原有的体系。并且这些只涉及到了主力野战部队，还有相当部分地方部队并没有纳入整编计划，陈敬云已经准备在各省设立警备司令部，负责管辖指挥各省的地方守备团等地方部队。
国民军、滇军、桂军三支军队完成改编后，南方联军将会拥有二十个中央陆军师，十三个中央混成旅的主力野战部队，这些部队之间的战斗力肯定是相差不等的，陈敬云嫡系的部队和陆荣廷乃是唐继尧的部队是没法比的，要知道当初国民军组建混成旅的时候，一个混成旅的作战目标可是桂军或者滇军的师，而国民军的师级部队则是用来对抗北洋主力师的部队。尽管里面相差甚大，但是二十个师十三个混成旅的架子总算是打出来了，南方联军的气势也就打出来了。